到下午三点钟左右，剩余的萨摩战船逃到了宫古岛海域，但这时宫古岛早己被成刚带领的第三分舰队占领，岛上的守军和战船不是被俘虏，就是被消灭。而成钢一见萨摩船队败过来，也带领着主力战船出海拦截，结果在商家军的前后夹击之下，萨摩船队果然一艘都没有逃掉，被商家军全歼。
到下午六时左右，亚莉桑徳拉带领着船队返回时，石垣岛也己被商家军收复，至此这一次先岛海战也全部结束，商家军的海军取得完胜，一共击沉萨摩战船三十二艘，击毙萨摩军的主将岛津忠朗、平田宗兴，打死萨摩士兵三千三百余人，俘虏十三艘，生擒萨摩士兵一千六百余人。其中还有四名翻译。而商家军自身，没有一艘战船被击沉，士兵也仅仅只阵亡了二百余人，而且基本都是在攻岛的时候战死的。
当天亚莉桑徳拉决定，今晚舰队在西表岛驻扎，一面派人回浙江去报告胜利的消息，一面又招集海军的将领，布置下一阶段的作战计划安排：在收复了石垣岛之后，接下来就是进攻琉球岛。
于是亚莉桑徳拉首先下令，停泊在基隆的后勤船队立刻赶到西表岛来，和大军汇合，然后出兵进攻琉球岛；莫亚和阿尓维斯带领着西班牙雇佣舰队，暂时留驻西表岛和石垣岛，把萨摩兵的俘虏都押送回台湾收押，并且从台湾征调一批士兵过来，因为这一次的作战目标是攻占琉球岛，需要一部份陆军守卫。
琉球群岛总体位于台湾到日本之间，大体呈南北走向，包括有主要岛屿五
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