不过高兴是短暂的，因为对于空军的后勤人员来说，他们并不喜欢装液冷发动机的二号机，原因是比风冷的M25发动机难伺候。而且不光是难伺候的问题，更关键是该机可伸缩的滑油散热器设计尽管很巧妙，但是散热效率实在差强人意，结果ANT40IS由于发动机冷却系统的故障导致引擎过热频频发生，特别是在爬升时尤甚！
其实解决这个问题的办法很简单，那就是将那个蛋疼的伸缩式滑油散热器改成固定式，重新设计发动机整流罩并扩大散热器进气口即可。当然，这么改，肯定要损失一定的速度。
那时候，空军和设计院认可了这个改动，但是主管航空工业的奥尔忠尼启则却不买这个账，一向很讨厌图波列夫的他，直接就开喷了，指责图波列夫的设计小组“故意”降低原设计性能。
为此不得不又大打嘴仗，哪怕是李晓峰出面做斯 大林和奥尔忠尼启则的工作也于事无补，最后官司直接打到了即将退休的列宁那里，还是导师大人一句话给解决了问题：“同志们，在航空设计中没有琐事，任何一个细节的疏忽都可能使我们失去珍贵的飞机和宝贵的飞行员，所以我个人尊重设计师同志的意见。”
好吧，列宁用一句话解决了争端，可是这不意味着ANT40项目就一帆风顺了，刚刚修改了散热器和整流罩没多久，二号原型机就再次败走麦城。在一次降落中损毁了起落架和部分后机身，导致试飞工作又一次被中
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