“土耳其余孽”、“土匪首领”等等罪名清理了一批约阿尼纳城周边的教士和地主，把他们的土地和财产搜刮一空，然后分配给了他手下脱离军队的人们，依靠这群人，他将建立一个稳固的统治核心。
而对剩下的上层人士，他则公开表示绝不为难他们，允许他们正常履行自己的，管理自己的财产，以免激起他们的反抗。
不过，在这个时候他还故意玩了分而治之的花招，选拔当地官吏的时候，有意优先挑选东正教徒，以便挑唆这两个教派之间的矛盾和对立——当然，在他的震慑之下，两个教派也不敢发生武力冲突，只能将彼此的怨愤埋藏在心，实际上也断绝了他们联合起来反对公国的能力。
在艾格隆的筹划下，未来的约阿尼纳公国的体制，可以看成是分几层的同心圆——以他自己和海黛作为核心，然后跟随着他进占约阿尼纳的骑士团成员们作为最高统治阶层，最重要的军政职务只由他们出任，而法利亚神父成为首相，以他的脑力来辅佐艾格隆驾驭这个最高层。
第二层是裁军之后留在军队里的士兵，他们是志愿来到希腊投靠艾格隆的波拿巴支持者，也是他眼下手中最核心的力量，也是他未来计划当中将会带去法国，接掌政权的骨干力量。
第三层就是归附于艾格隆、然后一起北上的希腊人，他们被艾格隆分配了约阿尼纳城周边的土地，成为了有耕地的自耕农，但同时也承担了接受艾格隆征召保卫公国的义务，他们是公国最忠心的保卫者
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